五脏病的用穴规律是首取背俞穴或原穴，也常用募穴。可单独使用，也可配合使用。此外，邪闭五脏出现神昏者，当刺井穴;欲调五脏阳气，当取荥穴。
如肺脏病可选取肺俞、太渊、中府;肝脏病可选取肝俞、太冲、期门;脾脏病可选取脾俞、太白、章门;肾病可选取肾俞、太溪、京门;心病可取厥阴俞、膻中、大陵。
心病为何要取心包的俞募穴和原穴呢?《灵枢·邪客第七十一》说：“故诸邪之在于心者，皆在于心之包络。”因为心包为心之外围，有代君受邪的作用，所以凡是由心之外的病邪侵犯心脏者，皆应治心包。由于心自身的原因产生的病症，方可治心，可取心俞、巨阙、神门。《素问·灵兰秘典论篇》说：“心者，君主之官，神明出焉;膻中者，臣使之官，喜乐出焉。”打个比方，如果说心是皇帝，心包则是皇帝身边的太监;如果有人要刺杀皇帝，必须先过太监这一关，此时与刺客战斗者，只能是太监而不是皇帝;相反，如果皇帝本人病了，让太监替皇帝喝药无济于事，只有治疗皇帝本人才行。
如果五脏病有明显的虚实，可按五输穴的生克补泻法选择穴位，如笑不休是心之实证，可针神门等。具体用穴见“时间性病症的一针疗法”一章中的“十二经脉虚实证生克补泻取穴表。”
根据五脏的开窍理论，五官九窍的病症也可治疗相应的五脏，如目病治肝、耳病治肾等。