柴胡桂枝汤出于《伤寒论》辨少阳病脉症并治全篇，本方是为太阳少阳合病而设，其病机由于太阳表邪未解，邪传少阳，故二阳合病，亦可在发病之初，太少同时受邪所致。其症有发热恶寒肢节烦疼之太阳表症，又有微呕，心下支结之少阳症。故设柴胡桂枝汤，双解太少二阳之邪。
【方药】柴胡、法夏、黄芩、人参、桂枝、白芍、甘草、大枣、生姜
【方义】本方小柴胡汤与桂枝汤组合之方剂，以桂枝祛太阳未尽之邪，以小柴胡汤和解少阳之邪，因两经症状较轻，故各取两方剂量之半。临床中凡遇太阳少阳合病之范畴。投以此方随症加减治之。举案如下。
刘某某 女 45
1975 年 9 月 2 日，感冒数日，仍头痛、头晕、口苦、寒热往来、背心痛、恶风寒、尿黄少。脉细弦，苔薄白。
【辨症】太阳、少阳合病兼邪入膀胱经。
【治宜】双解太阳少阳之邪兼清膀胱之邪。
【方药】柴胡12g 桂枝6g 白芍6g 黄芩6g 法夏6g 党参6g 甘草6g 大枣6g 生姜6g 滑石18g。二付。
【分析】该案感冒数日，目前仍头痛，背心痛，恶风寒，说明太阳未愈，头眩、口苦、寒热往来此属少阳经病，两者合病则称太阳少阳合病，柴胡桂枝汤即是专为太阳，少阳合病而设，由于太阳病已传入腑，膀胱受邪，故尿黄少，滑石专清膀胱内热，加入此方剂内。面面俱到，故此方药仅服二剂，全剂完，病尽除。
霍某某 男 45 家住金泉街药检所
1976 年 10 月 5 日，感冒数日，服药不效，卧床不起，应邀赴诊。目前：头痛恶寒微汗出，头眩、口苦、欲呕、寒热往来。脉弦细，苔白。
【辨症】太阳阳明合病症。
【治宜】双解二阳表邪。
【方药】柴胡12g 法夏6g 黄芩6g 党参6g 桂枝6g 白芍6g 甘草6g 大枣6g 生姜6g。二付。
【分析】该案起初因感冒而起，因服药不当，病情加重，卧床不起，邀余越家诊治。其病很明确。头痛、恶寒微汗出，此太阳中风，桂枝汤症，头眩、口苦、欲呕，寒热往来都是少阳小柴胡汤症，两者合病，将两汤合用，易如反掌。为何初起服药不效，病反加剧，不言自知，业医者不同其他行业，务必精益求精，应引以为戒。以本身做起。
杨某某 女 70 族中嫂夫人
1992 年 2 月 24 日，上午，三、四天来，冷得受不了，有时微热则汗出，口干思热饮，不思食，双太阳穴头痛、左脇痛。脉细胘无力，苔薄白。
【辨症】太阳少阳合病症。
【治宜】双解二阳之邪。
【方药】柴胡15g 法夏10g 黄芩10g 党参10g 桂枝10g 白芍10g 甘草10g 大枣10g 生姜10g。一付。
【说明】当天晚上姪女来说：中午、下午各服药一次，现基本已不恶寒微发热，口干思广柑。有耳鸣，上午忘记说，有食欲感，问是否改处方。嘱服完再考虑，一剂后痊愈。先有双膝滑囊炎痛，药后均愈。少阳经络循行两脇，故左肋痛愈。耳鸣少阳风邪故愈。太阳穴头痛属少阳，口苦咽干亦属少阳，故一剂药新病旧病均愈。
【原文】伤寒六、七日，发热微恶寒，肢节烦疼微呕，心下支结外症未去者，柴胡桂枝汤主之。方中：肢节，四肢骨节也。肢结，言饮搏聚而结也。
【集解】柯琴曰：仲景书中最重柴、桂二方，以桂枝解太阳肌表，又可以调诸经之肌表；小柴胡解少阳半表，亦可以和三阳之半表，故于六经病外，独有桂枝症，柴胡症之称。见二方之任不任重不拘于经也。如阳浮阴弱条，是仲景自为桂枝症之注释；血弱气尽条，是仲景自为柴胡注之注释。桂枝有坏病，柴胡亦有坏病；桂枝疑似症。柴胡亦有疑似症。如病似桂枝症，脚挛急与胸中痞硬者，及病以柴胡症。本渴而饮水呕，与但欲呕胸中痛者是也。此条言伤寒六、七日，寒热当退之时，反见发热恶寒诸表症，更见心下支结诸里症，表里不解，法当表里双解之矣。然恶寒微发热亦微，可知支节烦疼，则一身骨节不疼；可矢微呕心下亦微结，故谓之支结，是表证虽不去而已轻，里症虽已见而未甚，故取桂枝之半，以散太阳未尽之邪，取柴胡之半以解少阳微结之症，口不渴身有微热者，法当去人参，以六、七日邪虽未解，而正已虚，故仍用之，外症虽在，而病已见于里，故方以柴胡冠桂枝之上，为双解两阳之剂也。
《外台秘要》：仲景《伤寒论》：疗寒疝腹痛者，柴胡桂枝汤。《类聚方广义》发汗失期，胸脇满而呕，头痛、身痛，往来寒热，累日不愈，心下支撑，饮食不进者；或汗下之后，病犹不解，又不加重，但热气缠绕不去，胸满微恶寒，呕不欲食者，过数日而如愈不愈者，间亦有之，当先发热之期用此方，重复取汗。治疝家腰腹拘急，痛连胸脇，寒热休作，心下痞硬而呕者。妇人无故憎寒壮热，头痛眩晕，心下支结，呕吐恶心肢体酸软，或萎痺，郁郁恶对人，或频频欠伸者，俗谓之“血道”，宜此方或兼服泻心汤。《卫生宝鉴》治一切肌骨蒸热，寒热往来，或伤寒五、六日，发热、潮热发汗不解。现代医学报导：治体虚感冒或流行发热症；治早期肝硬化；风湿病：症见四肢烦痛，同时兼有胸脇苦满或脇背作痛等；肝气窜：自觉有气在周身走窜，气窜之处，有或痛或胀感；慢性胆囊炎或胆石症；治急腹症：急性胆囊炎、兰尾炎、胰腺炎、肠阻而无绝对手指征者；疟疾寒疝腹痛者；癫癎；其他等，都有报导。